Les missions définies par les statuts de la FAERE sont les suivantes :
- regrouper les chercheurs, les enseignants-chercheurs et toutes les personnes effectuant des travaux de recherche et/ou d’expertise en économie de l’environnement et des ressources naturelles
- centraliser les informations pertinentes pour les chercheurs dans ce domaine
- promouvoir tous types de travaux dans ce domaine
- entreprendre des démarches et actions visant à faire reconnaître ces travaux auprès des institutions privées et publiques
- entretenir des relations étroites avec les différentes associations ou instances pertinentes.